清洁生产审核和环境管理体系都是在环境保护从“末端治理”向实施“污染预防”转移的背景下产生和形成的，在许多方面有着相同的概念和思想，但又分属不同的体系，各自具有不同的特点，两者之间的主要区别如下。

    (1)实施目标不同

    清洁生产是直接采用技术改造，辅以加强管理。而ISO14000标准是以国家法律法规为依据，采用优良的管理，促进技术改造。

    (2)侧重点不同

    清洁生产着眼于生产本身，以改进生产、减少污染产生为直接目标，不断提出污染物削减或污染预防方案，使企业不断实现技术改造，在获得经济效益的同时获得良好的环境效益。而ISO 14000环境管理标准则侧重于管理，强调以国家法律、法规为依据，建立标准化、制度化、文件化的管理模式，以实现企业的污染预防和持续改进，并在获得第三方认证后，取得向公众及其他相关方的展示证明，以赢得商机并提高产品的市场竞争力。

    (3)审核方法不同

    清洁生产审核是由第三方根据产品生命周期分析和过程的物料、能源平衡，从原料选择、生产工艺改进、废弃物的处置等方面进行分析和核算，找出污染物产生的源头、数量和原因，进而提出若干个备选方案，并从技术、环境和经济方面综合评估，实施优化方案，实现对产品的投入、生产、使用和废弃全过程的污染预防和控制。ISO 14000则侧重于检查企业自我管理状况，其审核的对象是体系，目的是审核体系的符合性和有效性，使企业不断取得环境绩效。

    (4)作用不同

    清洁生产审核向技术人员和管理人员提供了一种新的环保和可持续发展思路，使企业环保工作重点转移到生产的全过程控制中来，从根本上减少了对环境的不良影响。ISO 14000则为管理层提供了一种先进的管理模式，使得环境管理纳入整体管理之中，让所有职工的环保意识都得以提高。